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विश्व स्वास्थ्य संगठन (WHO) के मुताबिक, निपाह वायरस संक्रमण एक जूनोटिक बीमारी (zoonotic disease) है । ये जानवरों के माध्यम से मनुष्यों में फैलती है। दूषित भोजन के माध्यम से, सीधे लोगों के बीच और फल चमगादड़ के कारण होती है।